Paket Lengkap Docking Analog Kurkumin Turunan Piperazindion Dengan Tubulin (1Tub) Rantai B Memakai Vina Dan Autodock
ABSTRAK: Program Autodock bisa memprediksi energi bebas dan konformasi ikatan antara fleksibelligan dan makromolekul sasaran yang telah diketahui. Senyawa turunan dan analog kurkumin adalahligan yang telah banyak dihasilkan dan diuji aktivitasnya. Beberapa diantaranya mempunyai khasiatyang lebih baik dari kurkumin. Enam senyawa turunan piperazindion, kurkumin, PGV-0, dan PGV-1dihitung energi meningkatkan secara optimal geometrinya memakai density functional theory (DFT) – Gaussian. Ligan hasil meningkatkan secara optimal dicari energi ikatan ligan dengan reseptor 1TUB rantai melalui dockingmenggunakan Vina dan Autodock dengan metode Lamarckian Genetic Algorithm (LGA), traditionalGenetic Algorithm (tGA), dan Simulated Annealing (SA) Monte Carlo. Data energi ikatan (affinitas) terbaik yang diperoleh dianalisis dengan Anova: Two-Factor Without Replication (P=0,01). Hasildocking dengan semua metode mengatakan bahwa senyawa analog kurkumin turunanpiperazindion mempunyai potensi ikatan lebih baik dibanding senyawa induknya
Kata Kunci: 1TUB, Autodock, docking, kurkumin, piperazindion
PENULIS: Broto Santoso
Kode Jurnal: jpfarmasidd110176
